在HACCP體系中，審核時除監控手段之外，用于確定并驗證企業是否按HACCP計劃運作所使用的方法、步驟或檢測手段。審核與監控的區別在于：監控提供了正在進行的生產過程中實際情況的信息，審核時檢查整個HACCP體系能否確保生產出符合規定、安全/高質量的食品，HACCP計劃所列的各項控制措施是否得到貫徹執行。通過審核所得到的信息可用于改進和完善HACCP體系。
HACCP體系審核的意義在于：①有助于強化全體員工的質量意識及其對質量體系的理解；②了解質量體系運轉的情況；③進行獨立和客觀的審查；④保證HACCP體系的可靠性；⑤確定改進的放向；⑥清楚過時的文件；⑦通過定期審計，不斷取得進步。
總之，HACCP體系審核可以確保整個體系的有效性，并確保體系的實際運作完全符合既定計劃。因此，審核的頻率必須足以保證所生產的食品始終能達到安全衛生的要求。
